Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCC1Q96CN9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCC1Q96CN9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms