Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOP1MTQ969P6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.7 ms