Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSC1Q92574 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSC1Q92574 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms