Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATRIPQ8WXE1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATRIPQ8WXE1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms