Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFT2D1Q8WV19 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms