Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WHAMMQ8TF30 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WHAMMQ8TF30 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms