Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HELQQ8TDG4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELQQ8TDG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms