Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHDC9Q8NEP7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC9Q8NEP7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC9Q8NEP7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms