Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM87AQ8NBN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM87AQ8NBN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms