Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ANKRD53Q8N9V6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms