Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPAP2Q8IXW5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPAP2Q8IXW5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms