Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG4DQ86TL0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATG4DQ86TL0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms