Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RD3Q7Z3Z2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RD3Q7Z3Z2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms