Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT27Q7Z3Y8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT27Q7Z3Y8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT27Q7Z3Y8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms