Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG9AQ7Z3C6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms