Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SV2BQ7L1I2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SV2BQ7L1I2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms