Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOA5Q6Q788 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOA5Q6Q788 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms