Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TTC41PQ6P2S7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC41PQ6P2S7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms