Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRHL2Q6ISB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRHL2Q6ISB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms