Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E4F1Q66K89 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms