Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GARNL3Q5VVW2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GARNL3Q5VVW2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms