Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MEX3CQ5U5Q3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MEX3CQ5U5Q3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms