Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
ERCC6L2Q5T890 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERCC6L2Q5T890 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ERCC6L2Q5T890 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms