Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARCH8Q5T0T0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH8Q5T0T0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms