Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CEP170Q5SW79 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CEP170Q5SW79 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CEP170Q5SW79 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms