Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAPCD1Q5SSQ6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms