Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP188Q5SRE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP188Q5SRE5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms