Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SSX2Q16385 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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SSX2Q16385 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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SSX2Q16385 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSX2Q16385 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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