Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LAMA4Q16363 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA4Q16363 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
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