Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CACNA1EQ15878 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1EQ15878 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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