Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNA2Q15822 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CHRNA2Q15822 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNA2Q15822 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
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