Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABEP1Q15276 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABEP1Q15276 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms