Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NKX1-1Q15270 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NKX1-1Q15270 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms