Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFRLQ15198 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFRLQ15198 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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