Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHPRHQ149N8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
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