Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBM39Q14498 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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