Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCNIQ14094 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCNIQ14094 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms