Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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KCNH2Q12809 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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KCNH2Q12809 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNH2Q12809 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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