Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3C1Q12789 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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GTF3C1Q12789 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GTF3C1Q12789 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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