Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 GAL80YML051W 1308 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG11Q12527 KIP3YGL216W 2418 nt3.91□□□□□ -1.78
ATG11Q12527 AVT5YBL089W 1380 nt3.9□□□□□ -1.78
ATG11Q12527 MGT1YDL200C 567 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 NTF2YER009W 378 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 GET1YGL020C 708 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 VPS51YKR020W 495 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YML084WYML084W 309 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PAI3YMR174C 207 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 IMP4YNL075W 873 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 HUB1YNR032C-A 222 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 RSF2YJR127C 4143 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PRM15YMR278W 1869 nt3.9□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MNL1YHR204W 2391 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 ATG31YDR022C 591 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PAU10YDR542W 363 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PAU11YGL261C 363 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PAU13YHL046C 363 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YIR020CYIR020C 303 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 CSE4YKL049C 690 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MCR1YKL150W 909 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PAU4YLR461W 363 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 CMD1YBR109C 444 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 AVT7YIL088C 1473 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MTC4YBR255W 2085 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SWH1YAR042W 3567 nt3.89□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PES4YFR023W 1836 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PPZ1YML016C 2079 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MCD4YKL165C 2760 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 GAC1YOR178C 2382 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 CHZ1YER030W 462 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 COX2Q0250 756 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 REC104YHR157W 549 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 EMC2YJR088C 879 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YKE2YLR200W 345 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 TPK2YPL203W 1143 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MRPS9YBR146W 837 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 NUP85YJR042W 2235 nt3.88□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 FAT1YBR041W 2010 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SEG1YMR086W 2883 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YHR138CYHR138C 345 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YIL175WYIL175W 318 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 ACF4YJR083C 930 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SEC22YLR268W 645 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 DDR48YMR173W 1293 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 CAT5YOR125C 702 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MSS18YPR134W 807 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 FRM2YCL026C-A 582 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MUD2YKL074C 1584 nt3.87□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 ADY4YLR227C 1482 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 PMT6YGR199W 2280 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SLA1YBL007C 3735 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 IMH1YLR309C 2736 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 TIF11YMR260C 462 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 NGL1YOL042W 1092 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YPR003CYPR003C 2265 nt3.86□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 KRE5YOR336W 4098 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 RPS29BYDL061C 171 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 TMA19YKL056C 504 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 AIM29YKR074W 468 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 IDP2YLR174W 1239 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YOL159CYOL159C 516 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YOR105WYOR105W 327 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YOR248WYOR248W 303 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SVS1YPL163C 783 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 AFT2YPL202C 1251 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YPR050CYPR050C 414 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 SPT6YGR116W 4356 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 RPN3YER021W 1572 nt3.85□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 MIP6YHR015W 1980 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 STU1YBL034C 4542 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YDR262WYDR262W 819 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YGL039WYGL039W 1047 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YGR051CYGR051C 324 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 ECL1YGR146C 636 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 RPB3YIL021W 957 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YKT6YKL196C 603 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 IES3YLR052W 753 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 NNT1YLR285W 786 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YLR297WYLR297W 390 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 CTK3YML112W 891 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YNL146WYNL146W 303 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 RPL18AYOL120C 561 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 YPL034WYPL034W 498 nt3.84□□□□□ -1.79
ATG11Q12527 NCS2YNL119W 1482 nt3.84□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 RAD26YJR035W 3258 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 YAP3YHL009C 993 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 YHR125WYHR125W 306 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 YKL044WYKL044W 321 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 DAD2YKR083C 402 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 RFC3YNL290W 1023 nt3.83□□□□□ -1.8
ATG11Q12527 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms