Protein–RNA interactions for Protein: Q12489

YDL012C, Cysteine-rich and transmembrane domain-containing protein YDL012C, yeastyeast

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL012CQ12489 snR35snR35 204 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 NUP85YJR042W 2235 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YRM1YOR172W 2361 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SLK19YOR195W 2466 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 STU1YBL034C 4542 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 DAL5YJR152W 1632 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YEH2YLR020C 1617 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SSM4YIL030C 3960 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MDM36YPR083W 1740 nt2.31□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MTR4YJL050W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 CAF130YGR134W 3369 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 IRC3YDR332W 2070 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 TAF1YGR274C 3201 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SPI1YER150W 447 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MCR1YKL150W 909 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 AIM29YKR074W 468 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 DAD2YKR083C 402 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YLR224WYLR224W 1110 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YLR428CYLR428C 345 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YML084WYML084W 309 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 RIO2YNL207W 1278 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YOR131CYOR131C 657 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YOR331CYOR331C 558 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YPR050CYPR050C 414 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 TRS120YDR407C 3870 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 ADY4YLR227C 1482 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 PEP7YDR323C 1548 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MUD2YKL074C 1584 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 FAR8YMR029C 1572 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YKR078WYKR078W 1758 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MIP6YHR015W 1980 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 PPN1YDR452W 2025 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YBR225WYBR225W 2703 nt2.3□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YPR022CYPR022C 3402 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SIN4YNL236W 2925 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 AIM21YIR003W 2040 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 KAR9YPL269W 1935 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SPA2YLL021W 4401 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 NCS2YNL119W 1482 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YDR537CYDR537C 606 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 OTU1YFL044C 906 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YGR051CYGR051C 324 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MTM1YGR257C 1101 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YAP3YHL009C 993 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 PCL5YHR071W 690 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 TDA8YAL064C-A 381 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YLR297WYLR297W 390 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YOR248WYOR248W 303 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MBA1YBR185C 837 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 FRE4YNR060W 2160 nt2.29□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 FUN12YAL035W 3009 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SHS1YDL225W 1656 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 FLO10YKR102W 3510 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 RIM13YMR154C 2184 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 snR59snR59 78 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 MGT1YDL200C 567 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YEL075CYEL075C 369 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YFL065CYFL065C 309 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YGR017WYGR017W 894 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 PDX1YGR193C 1233 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 ANB1YJR047C 474 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YKL044WYKL044W 321 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SEC22YLR268W 645 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 ARC18YLR370C 537 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SHH3YMR118C 591 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YNL089CYNL089C 477 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 LDS2YOL047C 1071 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YOL159CYOL159C 516 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 SRL1YOR247W 633 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 YPR096CYPR096C 303 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 FRM2YCL026C-A 582 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 DAS1YJL149W 1992 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 PRP22YER013W 3438 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 REB1YBR049C 2433 nt2.28□□□□□ -2.04
YDL012CQ12489 ERG5YMR015C 1617 nt2.28□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 LOS1YKL205W 3303 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 GDH2YDL215C 3279 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 APC5YOR249C 2058 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 VAC14YLR386W 2643 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 SWC4YGR002C 1431 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 BEM4YPL161C 1902 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 PDR12YPL058C 4536 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 RPN6YDL097C 1305 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 PES4YFR023W 1836 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 CPA2YJR109C 3357 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 CPR5YDR304C 678 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 YDR431WYDR431W 312 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 YER079WYER079W 633 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 MIC19YFR011C 513 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 YAR070CYAR070C 300 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 YBL028CYBL028C 321 nt2.27□□□□□ -2.05
YDL012CQ12489 AAR2YBL074C 1068 nt2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.2 ms