Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 FOL1YNL256W 2475 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 PSP1YDR505C 2526 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 MAK31YCR020C-A 267 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 CAJ1YER048C 1176 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 PNP1YLR209C 936 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 ILV5YLR355C 1188 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 RPS15YOL040C 429 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 INO4YOL108C 456 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 CLF1YLR117C 2064 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 BUL1YMR275C 2931 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 BAR1YIL015W 1764 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 AIM26YKL037W 357 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YAL065CYAL065C 387 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YLR428CYLR428C 345 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 SSN8YNL025C 972 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 NDD1YOR372C 1665 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 TOM70YNL121C 1854 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 HUL5YGL141W 2733 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 ATG21YPL100W 1491 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-DR3Q12441 YER076W-AYER076W-A 348 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RAD6YGL058W 519 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YIL141WYIL141W 390 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PHS1YJL097W 654 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PGA1YNL158W 597 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 IDH2YOR136W 1110 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YPR059CYPR059C 387 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 DPB3YBR278W 606 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 EAP1YKL204W 1899 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PRP28YDR243C 1767 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 UTP15YMR093W 1542 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 BIO2YGR286C 1128 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 VPS29YHR012W 849 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 AIM46YHR199C 933 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YAE1YJR067C 426 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RPL8BYLL045C 771 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 TAF9YMR236W 474 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 snR13snR13 124 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YGR125WYGR125W 3111 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 TUP1YCR084C 2142 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YBP1YBR216C 2025 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YFL034WYFL034W 3222 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PSE1YMR308C 3270 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YDL211CYDL211C 1119 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SDH6YDR379C-A 240 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 HMF1YER057C 390 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YGL149WYGL149W 306 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 NIT2YJL126W 924 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YJR085CYJR085C 318 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 ILV6YCL009C 930 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 FKH2YNL068C 2589 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 MNT2YGL257C 1677 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RNA14YMR061W 2034 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 CPS1YJL172W 1731 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PTR3YFR029W 2037 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YPS6YIR039C 1614 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 LPP1YDR503C 825 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 GCG1YER163C 699 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RPL15AYLR029C 615 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YAR068WYAR068W 486 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RPL16BYNL069C 597 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YOR131CYOR131C 657 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 snR42snR42 351 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 THI7YLR237W 1797 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 ICR1ICR1 3199 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 AXL2YIL140W 2472 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YOL153CYOL153C 1746 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YDR134CYDR134C 411 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 VEL1YGL258W 621 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SIP18YMR175W 240 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 snR17bsnR17b 332 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SKM1YOL113W 1968 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 IKS1YJL057C 2004 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YDL199CYDL199C 2064 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SKG3YLR187W 3081 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 VHC1YBR235W 3363 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YDR344CYDR344C 444 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YGL088WYGL088W 366 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 ABF2YMR072W 552 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SPE3YPR069C 882 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 PHO88YBR106W 567 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 VHR2YER064C 1518 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 KRS1YDR037W 1776 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RSC6YCR052W 1452 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 AUA1YFL010W-A 285 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 RPL30YGL030W 318 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 CUP2YGL166W 678 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 LCL2YLR104W 396 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YLR177WYLR177W 1887 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 ESF2YNR054C 951 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 SIL1YOL031C 1266 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 YPL229WYPL229W 621 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 MRPS5YBR251W 924 nt4.59□□□□□ -1.67
TY1A-DR3Q12441 GPR1YDL035C 2886 nt4.59□□□□□ -1.68
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