Protein–RNA interactions for Protein: Q12414

TY1B-PL, Transposon Ty1-PL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-PLQ12414 COS3YML132W 1140 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 COS2YBR302C 1140 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 YLR422WYLR422W 5799 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 USO1YDL058W 5373 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 YCR099CYCR099C 468 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 RNR4YGR180C 1038 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 NRG2YBR066C 663 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 AGE1YDR524C 1449 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 VPS3YDR495C 3036 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 CTK2YJL006C 972 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-PLQ12414 HOS4YIL112W 3252 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 EAF5YEL018W 840 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 SCP1YOR367W 603 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 ISF1YMR081C 1017 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 OSW5YMR148W 447 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 SYH1YPL105C 2550 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 DOP1YDR141C 5097 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 ART10YLR392C 1557 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 ERP3YDL018C 678 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 HPA3YEL066W 540 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 ALB1YJL122W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 HRI1YLR301W 735 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 IBA57YJR122W 1494 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 PEX5YDR244W 1839 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 SEC3YER008C 4011 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 RPS18AYDR450W 441 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YBL073WYBL073W 312 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 TAF14YPL129W 735 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 CCM1YGR150C 2595 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 VPS54YDR027C 2670 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 RIC1YLR039C 3171 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 MRP10YDL045W-A 288 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 SNL1YIL016W 480 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 HAL1YPR005C 885 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 UBX3YDL091C 1368 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 MIG1YGL035C 1515 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 ERG29YMR134W 714 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 RPB11YOL005C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 CNS1YBR155W 1158 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YDL199CYDL199C 2064 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 TPO5YKL174C 1857 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 YPR097WYPR097W 3222 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 LHS1YKL073W 2646 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-PLQ12414 RPL20AYMR242C 519 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 INA17YPL099C 549 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YGR111WYGR111W 1203 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 RRP14YKL082C 1305 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 MLP2YIL149C 5040 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 PLC1YPL268W 2610 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 ARR2YPR200C 393 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 KXD1YGL079W 657 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 COG2YGR120C 789 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 INA22YIR024C 651 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 MTR2YKL186C 555 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 ERP1YAR002C-A 660 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 SHE9YDR393W 1371 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 TOM70YNL121C 1854 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YIR014WYIR014W 729 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 MPD2YOL088C 834 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YOR289WYOR289W 756 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 SLM1YIL105C 2061 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 UTP5YDR398W 1932 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 FMP48YGR052W 1110 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YHI9YHR029C 885 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 TSR4YOL022C 1227 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 POL5YEL055C 3069 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 MDM32YOR147W 1869 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 UFD2YDL190C 2886 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 SPC98YNL126W 2541 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 AGC1YPR021C 2709 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 SRD1YCR018C 666 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 YLR224WYLR224W 1110 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 UTP13YLR222C 2454 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 CSE4YKL049C 690 nt1.97□□□□□ -2.09
TY1B-PLQ12414 REV1YOR346W 2958 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 UTP20YBL004W 7482 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 snR3snR3 194 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 YLR345WYLR345W 1530 nt1.96□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 CTH1YDR151C 978 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 GRX3YDR098C 858 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 SNO3YFL060C 669 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 SEN15YMR059W 387 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 SNO2YNL334C 669 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 YOR292CYOR292C 930 nt1.95□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 DAS2YDR020C 699 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.94□□□□□ -2.1
TY1B-PLQ12414 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.94□□□□□ -2.1
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