Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 RPS25AYGR027C 327 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 SSN8YNL025C 972 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 CNS1YBR155W 1158 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 VPS54YDR027C 2670 nt2.13□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 MCD1YDL003W 1701 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 TOP2YNL088W 4287 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 UTP13YLR222C 2454 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 HRI1YLR301W 735 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 MAC1YMR021C 1254 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 IBA57YJR122W 1494 nt2.12□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 ELG1YOR144C 2376 nt2.11□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 COS3YML132W 1140 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 SCP1YOR367W 603 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 COS2YBR302C 1140 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 PLC1YPL268W 2610 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YKR047WYKR047W 306 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 PSY3YLR376C 729 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YLR422WYLR422W 5799 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.1□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YCR099CYCR099C 468 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YLR224WYLR224W 1110 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 PIS1YPR113W 663 nt2.09□□□□□ -2.07
TY1B-GR3Q12316 YKU80YMR106C 1890 nt2.09□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 SNL1YIL016W 480 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 YKL071WYKL071W 771 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 SEC3YER008C 4011 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 RPS18AYDR450W 441 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 INA22YIR024C 651 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 RPB11YOL005C 363 nt2.08□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 ALB1YJL122W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 NRG2YBR066C 663 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 MIG1YGL035C 1515 nt2.07□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 APM1YPL259C 1428 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 RIC1YLR039C 3171 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 CTH1YDR151C 978 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 SHE9YDR393W 1371 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 DOP1YDR141C 5097 nt2.06□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 EAF5YEL018W 840 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 TAF14YPL129W 735 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 MLP2YIL149C 5040 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 MDM32YOR147W 1869 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 UTP5YDR398W 1932 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 CCM1YGR150C 2595 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 HPA3YEL066W 540 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 ERG29YMR134W 714 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 INA17YPL099C 549 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 HAL1YPR005C 885 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 UFD2YDL190C 2886 nt2.05□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 ART10YLR392C 1557 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 ERP3YDL018C 678 nt2.04□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 MRP10YDL045W-A 288 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 LHS1YKL073W 2646 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 SLM1YIL105C 2061 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 VPS15YBR097W 4365 nt2.03□□□□□ -2.08
TY1B-GR3Q12316 RPL20AYMR242C 519 nt2.03□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YPR097WYPR097W 3222 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 UTP20YBL004W 7482 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 SNO3YFL060C 669 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YGR111WYGR111W 1203 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 SNO2YNL334C 669 nt2.02□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YHI9YHR029C 885 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 DCG1YIR030C 735 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 ERP1YAR002C-A 660 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 POL5YEL055C 3069 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 PKH3YDR466W 2697 nt2.01□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 UBX3YDL091C 1368 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 SRD1YCR018C 666 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 KXD1YGL079W 657 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 MTR2YKL186C 555 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YDL199CYDL199C 2064 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 MMS22YLR320W 4365 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 FMP48YGR052W 1110 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 COG2YGR120C 789 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 EAF7YNL136W 1278 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 MPD2YOL088C 834 nt2□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 TOM70YNL121C 1854 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 PET100YDR079W 336 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 GRX3YDR098C 858 nt1.99□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 SPC98YNL126W 2541 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 RRP14YKL082C 1305 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 REV1YOR346W 2958 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 DAS2YDR020C 699 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YIR014WYIR014W 729 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YOR289WYOR289W 756 nt1.98□□□□□ -2.09
TY1B-GR3Q12316 YJR061WYJR061W 2808 nt1.97□□□□□ -2.09
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