Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CPSF1Q10570 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPSF1Q10570 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPSF1Q10570 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
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