Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCBP1Q09161 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCBP1Q09161 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms