Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSC1Q08554 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms