Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LOXL1Q08397 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LOXL1Q08397 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms