Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP4Q07065 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP4Q07065 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms