Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 NNT1YLR285W 786 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MSN1YOL116W 1149 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RPL25YOL127W 429 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MCT1YOR221C 1083 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YOR283WYOR283W 693 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YOR331CYOR331C 558 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 CBP6YBR120C 489 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YKL075CYKL075C 1353 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 VPS9YML097C 1356 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SEC16YPL085W 6588 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YNR066CYNR066C 1311 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 AVT2YEL064C 1443 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 VIP1YLR410W 3441 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MPS2YGL075C 1164 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RFC5YBR087W 1065 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 OSW7YFR039C 1533 nt2.17□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SKP2YNL311C 2292 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YBT1YLL048C 4986 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MSB1YOR188W 3414 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 EAP1YKL204W 1899 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SNU23YDL098C 585 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 TCA17YEL048C 459 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RTT105YER104W 627 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SPT15YER148W 723 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SDO1YLR022C 753 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 ECM13YBL043W 774 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 HBT1YDL223C 3141 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MUS81YDR386W 1899 nt2.16□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 EDS1YBR033W 2760 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 TPS2YDR074W 2691 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 AI4Q0065 1671 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YDR131CYDR131C 1671 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SWA2YDR320C 2007 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 JIP5YPR169W 1479 nt2.15□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 IRC3YDR332W 2070 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 COBQ0105 1158 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 RPB9YGL070C 369 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PPE1YHR075C 1203 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PFS1YHR185C 714 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MET14YKL001C 609 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 HAT1YPL001W 1125 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ISU1YPL135W 498 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 BNI4YNL233W 2679 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 DNA2YHR164C 4569 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 SAP185YJL098W 3177 nt2.15□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MCD1YDL003W 1701 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YCL019WYCL019W 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YRB1YDR002W 606 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 AI3Q0060 1248 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YGR111WYGR111W 1203 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 AYR1YIL124W 894 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YLL044WYLL044W 447 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YNL043CYNL043C 321 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YOL118CYOL118C 309 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 APC5YOR249C 2058 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 TAE2YPL009C 3117 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YNL011CYNL011C 1335 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MPS1YDL028C 2295 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 NEL1YHR035W 1893 nt2.14□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YFH1YDL120W 525 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 UPF3YGR072W 1164 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ENP2YGR145W 2124 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 TDA10YGR205W 873 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MMF1YIL051C 438 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ERV41YML067C 1059 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 BET5YML077W 480 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 SUB1YMR039C 879 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ATG34YOL083W 1239 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 HSP10YOR020C 321 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 SRL1YOR247W 633 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 BNI1YNL271C 5862 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MAK5YBR142W 2322 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 FIR1YER032W 2631 nt2.13□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 IPI3YNL182C 1668 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ARP9YMR033W 1404 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 GET1YGL020C 708 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ICS2YBR157C 768 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 DPB3YBR278W 606 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YJL181WYJL181W 1836 nt2.12□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 TMN3YER113C 2121 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 MRPL38YKL170W 417 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 GSP1YLR293C 660 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PRE8YML092C 753 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 CTL1YMR180C 963 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 THI80YOR143C 960 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YPL276WYPL276W 438 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 LTP1YPR073C 486 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 ERV15YBR210W 429 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PBP2YBR233W 1242 nt2.11□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 CWH41YGL027C 2502 nt2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.5 ms